ברובע היהודי של פראג, הנקרא רובע יוזפוב (Josefov), נמצא כיום המוזיאון היהודי של פראג הכולל ארבעה בתי כנסת, שבכולם מוצגים המנציחים את מורשת יהדות בוהמיה ומורביה – בית הכנסת מייזל, בית הכנסת הספרדי, בית הכנסת פינקס ובית הכנסת קלאוזן. לצדם נמצא בית הכנסת סטרנובה (אלטנוישול, ישן-חדש), ובית הקברות היהודי העתיק, בו כ- 12 אלף מצבות, ובהן מצבה של הרב יהודה ליווא בן בצלאל – המהר"ל.

בית הקברות פעל בשנים 1439-1787. מלבד מבני בתי הכנסת והקהילה, כל הבתים העתירים נהרסו בסוף המאה ה-19 ותחילת המאה ה-20 במסגרת שיפוץ הרובע שנעשה על ידי העירייה. לאחר השיפוץ הוקם המוזיאון היהודי, שהשתמר גם בשואה. באזור אחר (כיום אזור 3 בעיר) יש בית קברות נוסף בשם ז'יז'יקוב‏[3], שהחל לפעול בשנת ת"מ (1680). ריחוקו מהרובע היהודי היה בשל כך שקברו בו הרוגי מגפה, והשלטונות שפחדו מהידבקות, הורו לקבור את המתים באזור מגורים. מאה שנה לאחר מכן, החלו לקבור בקביעות בבית קברות זה עד לשנת תר"נ (1890). בית קברות זה נמצא בסמוך לבית קברות נוצרי.

בין השנים תשמ"ה – תשנ"ב נבנה על שטח בית הקברות מגדל רדיו, ונותרה ממנו רק חלקה קטנה של רבנים. בבית קברות זה קבורים ה"נודע ביהודה" ובניו רבי שמואל לנדא ורבי ישראל, רבי אלעזר פלקלש, רבי בצלאל רגשנבורג ועוד. בקירוב לבית קברות זה נמצא בית הקברות החדש, המשמש כיום את יהודי העיר, שנפתח בשנת תר"נ. בית כנסת נוסף, פעיל עד היום, הוא "בית כנסת הירושלמי", הנמצא ברחוב ירושלים, במרחק מהרובע היהודי. בבית כנסת זה ישנה תערוכה של שיקום יהדות פראג לאחר השואה. בית הכנסת נבנה בשנת תרנ"ז. בימי מלחמת העולם השנייה הוא שימש כמחסן, והודות לכך שרד. בתחילת שנות ה-2000 נערך שיפוץ בבית הכנסת ונמצאה מגילת קלף המתארת את בניית בית הכנסת ובעלי המלאכה שעבדו בו.

צדיקים הטמונים שם: (בפראג קבורים צדיקים רבים להלן המפורסמים יותר)

רבי יהודה לוואי המכונה המהר"ל מפרג זיע"א
רבי דוד אופנהיימר הראשון בעל נשאל דוד זיע"א 
רבי שלמה אפריים בעל ספר 'כלי יקר' זיע"א
רבי אביגדור קרא זיע"א   רבי אברהם קרא זיע"א 
רבי מאיר שיף המכונה מהר"ם שי"ף זיע"א
רבי יצחק חיות זיע"א – רבי אברהם חיות זיע"א
רבי יחזקאל לנדא המכונה הנודע ביהודה
רבי שמואל ב"ר יחזקאל לנדא זיע"א